MARC details
| 000 -LEADER |
|---|
| campo de control de longitud fija |
02433naa a2200325 a 4500 |
| 003 - IDENTIFICADOR DE NÚMERO DE CONTROL |
|---|
| campo de control |
AR-LpUFIB |
| 005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN |
|---|
| campo de control |
20240131171302.0 |
| 007 - CAMPO FIJO DE DESCRIPCIÓN FÍSICA--INFORMACIÓN GENERAL |
|---|
| campo de control de longitud fija |
ta |
| 008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL |
|---|
| campo de control de longitud fija |
230201s2018 xx do 000 0 eng d |
| 024 8# - IDENTIFICADOR DE OTROS ESTÁNDARES |
|---|
| Número estándar o código |
DIF007620 |
| 040 ## - FUENTE DE CATALOGACIÓN |
|---|
| Centro catalogador/agencia de origen |
AR-LpUFIB |
| Lengua de catalogación |
spa |
| Centro/agencia transcriptor |
AR-LpUFIB |
| 100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA |
|---|
| Nombre de persona |
Rucci, Enzo |
| 9 (RLIN) |
252384 |
| 245 10 - MENCIÓN DEL TÍTULO |
|---|
| Título |
SWIMM 2.0 : |
| Resto del título |
enhanced Smith–Waterman on Intel’s multicore and manycore architectures based on AVX-512 vector extensions |
| 260 ## - PUBLICACIÓN, DISTRIBUCIÓN, ETC. |
|---|
| Lugar de publicación, distribución, etc. |
: |
| Nombre del editor, distribuidor, etc. |
, |
| Fecha de publicación, distribución, etc. |
2018 |
| 300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA |
|---|
| Extensión |
1 archivo (1,6 MB) |
| 500 ## - NOTA GENERAL |
|---|
| Nota general |
Formato de archivo PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca) |
| 520 ## - RESUMEN, ETC. |
|---|
| Sumario, etc. |
The well-known Smith–Waterman (SW) algorithm is the most commonly used method for local sequence alignments, but its acceptance is limited by the computational requirements for large protein databases. Although the acceleration of SW has already been studied on many parallel platforms, there are hardly any studies which take advantage of the latest Intel architectures based on AVX-512 vector extensions. This SIMD set is currently supported by Intel’s Knights Landing (KNL) accelerator and Intel’s Skylake (SKL) general purpose processors. In this paper, we present an SW version that is optimized for both architectures: the renowned SWIMM 2.0. The novelty of this vector instruction set requires the revision of previous programming and optimization techniques. SWIMM 2.0 is based on a massive multi-threading and SIMD exploitation. It is competitive in terms of performance compared with other state-of-the-art implementations, reaching 511 GCUPS on a single KNL node and 734 GCUPS on a server equipped with a dual SKL processor. Moreover, these successful performance rates make SWIMM 2.0 the most efficient energy footprint implementation in this study achieving 2.94 GCUPS/Watts on the SKL processor. |
| 534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL |
|---|
| Encabezamiento principal del original |
International Journal of Parallel Programming, 47(2), pp. 296-316. |
| 650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA |
|---|
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada |
ALGORITMOS |
| 9 (RLIN) |
176265 |
| 653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO |
|---|
| Término no controlado |
Smith-Waterman |
| 653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO |
|---|
| Término no controlado |
Xeon-Phi |
| 700 1# - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL |
|---|
| Nombre de persona |
García Sanchez, Carlos |
| 9 (RLIN) |
245198 |
| 700 1# - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL |
|---|
| Nombre de persona |
Botella, Guillermo |
| 9 (RLIN) |
257683 |
| 700 1# - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL |
|---|
| Nombre de persona |
De Giusti, Armando Eduardo |
| 9 (RLIN) |
248540 |
| 700 1# - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL |
|---|
| Nombre de persona |
Naiouf, Ricardo Marcelo |
| 9 (RLIN) |
248556 |
| 700 1# - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL |
|---|
| Nombre de persona |
Prieto-Matias, Manuel |
| 9 (RLIN) |
257513 |
| 856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS |
|---|
| Identificador Uniforme de Recursos |
<a href="https://doi.org/10.1007/s10766-018-0585-7">https://doi.org/10.1007/s10766-018-0585-7</a> |
| 856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS |
|---|
| Identificador Uniforme de Recursos |
<a href=" http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=2306"> http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=2306</a> |
| 942 ## - ELEMENTOS DE ENTRADA SECUNDARIOS (KOHA) |
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| Tipo de ítem Koha |
Capítulo de libro |