Caracterización de los haplotipos del complejo principal de histocompatibilidad (ELA) en diferentes razas equinas

Tesis

Doctor en Ciencias Veterinarias. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias 2014

Los haplotipos son definidos como la combinación particular de alelos presentes en una población o como un grupo de ligamiento cerrado. La asociación entre cada alelo y su haplotipo ancestral sólo se modifica por la aparición de una mutación o por recombinación. Por lo tanto, es posible su seguimiento mediante el uso de marcadores e identificando elsegmento ancestral donde se produjo la mutación. Si tenemos en cuenta el mercado desequilibrio de ligamiento del MHC y la presencia de un gran número de genes involucrados en la respuesta inmune que se segregan en forma conjunta, es de esperar que la resistencia/susceptibilidad a una enfermedad infecciosa o autoinmune no sólo este determinada por la presencia de una variante alélica en un gen dado sino por la combinación haplotípica de varios de los genes del MHS. Sobre la base de esta hipótesis, en el presente estudio se realizó la tipificación de los SNPs, presente estudio se realizó la tipificación de los SNPs, presentes en los genes TNF- y ELA-DRA, mediante secuenciación directa y pirosecuenciación, y la genotipificación de 4 marcadores micrsatélites abarcando la totalidad del Complejo Principal de Histovompatibilidad Equino (ELA) en 7 razas equinas. Haplotypes are defined as the particular combination of the present alleles in group of people or as a closed linkage group. The association between each allele and its ancestral haplotype is only modified by the appearance of a mutation or recombination. Thus, the haplotype tracing is possible throughout the use of markers and the identification of the ancestral segments where the mutation was produced.Taking into account the linkage desequilibrium of the MHC and the presence of a great number of genes involved in the immune response that segregated together, it es expected that the resistance/susceptibility to an infectious or autoimmune disease was not only determined by the presence of an allelic variant in certain gene, but also by the haplotype combination of several genes of the MHC. Based on this hypothesis, the main objective of the present work was to genotype SNPs present in the TNF- and ELA-DRA genes by direct sequencing and pyrosequencing methods, and four micrsatellite markers coverin the entire Equine Lymphocyte Antigen (ELA) in seven equine breeds.